Сила роста, долговечность, обеспечение дерева водой и минеральными солями во многом зависят от мощности развития корневой системы. Культурные сорта абрикоса возделывают только привитыми, и, естественно, корневая система у него характерна для того вида, который использован в качестве подвоя, со всеми ее биологическими особенностями. В то же время она может претерпевать некоторые изменения в зависимости от уровня агротехники и привитого сорта.

Вообще корневая система абрикоса, выращенного без прививки или привитого на сеянцах культурных сортов или жерделе, располагается на двух уровнях. Корни большей частью размещены в поверхностных горизонтах почвы. Исследования, проведенные в зоне бурых лесных почв, доказали, что большинство горизонтальных скелетных и обрастающих корней размещается в почвенном горизонте на глубине от 20 до 60 см.

Радиус распространения этих корней превышает радиус проекции кроны примерно в 2 раза. Остальные корни, около 10%, проникают в более глубокие горизонты и на прогреваемых, хорошо аэрированных почвах достигают глубины 4—4,5 м и даже больше. Такое размещение корневой системы абрикоса обеспечивает хорошее использование влаги из глубоких слоев почвы, особенно в местах с продолжительными засухами.

Глубокое размещение корневой системы абрикоса указывает на то, что эта культура происходит из засушливых мест. Такая корневая система значительно увеличивает устойчивость деревьев к морозу и засухе. Развитие корневой системы абрикоса в большой степени зависит также от почвенных условий и тесно коррелирует с развитием надземной части дерева.

Так, у сорта Бухарестский поздний, у которого надземная часть сравнительно небольшая, количество и сила роста корней намного меньше, чем у других сортов, например у сорта Венгерский превосходный, который имеет мощную, хорошо проникающую в почву корневую систему. Знание характера проникновения и мощности развития корневой системы имеет большое значение при выращивании абрикоса, особенно при установлении площади питания при посадке.