Половые органы матки состоят из парных яичников, парного и непарного яйцеводов, влагалища и семяприемника. Яичники размещены в брюшке. По форме напоминают грушу. Каждый яичник состоит из яйцевых трубочек, тонких в начале и постепенно расширяющихся к концу. У плодовитых маток их количество достигает 180—200, а у мелких они менее развиты, их всего 120—140. В яйцевых трубках зарождаются и развиваются яйца. У крупных маток каждая трубочка имеет 12—13 камер, а у менее развитых — не более 6—8. Именно от количества и величины трубочек и камер зависит плодовитость матки.

Созревшее яйцо из яйцевых трубочек попадает в парные яйцеводы, которые затем сливаются в один непарный. Яйцевод переходит во влагалище и заканчивается половой щелью. В том месте, где парные яйцеводы переходят в непарный, открывается проток семяприемника. Здесь сперматозоиды попадают на яйца, проходящие по яйцеводу. На одно яйцо попадает более 10 сперматозоидов.

Сперматозоиды представляют собой тонкие нити, совершающие зигзагообразные движения. Попав на оболочку яйца, один из них первым проникает внутрь и сливается с ядром яйцеклетки. Остальные растворяются в ее цитоплазме.

Половые органы рабочей пчелы состоят из двух недоразвитых яичников, которые содержат 4—6 или более 18—21 также недоразвитых яйцевых трубочек. Рабочая пчела утратила способность к спариванию и не имеет семяприемника. При отсутствии долгого времени в семье матки у части рабочих пчел яичники увеличиваются в объеме и даже выделяют яйца. Но они не оплодотворяются и из них выходят только слаборазвитые трутни.

Половые органы трутня состоят из двух семенников, половых путей с придаточными железами и копулятивного органа. Многочисленные семенные канальцы, вернее слегка извилистые трубочки, образуют структуру семенников. Именно в этих трубочках и созревают сперматозоиды в первые дни жизни трутня. Затем сперматозоиды перемещаются в семенные пузырьки. У взрослого трутня они увеличиваются в размере и в них «складируется» сперма. Семенной пузырек, суживаясь на конце, впадает в просвет большой придаточной железы, вырабатывающей слизь.

Далее отходит семяизвергательный канал, расширяющийся в луковицу. В конце переходит в сложно устроенный копулятивный аппарат. Если у матки половые клетки образуются постоянно, то у трутня сперматозоиды зарождаются только в начале его жизни. Таким образом, мужская особь пчелиной семьи является носителем нескольких миллионов сперматозоидов, готовых уже при его рождении.