Почкующиеся бактерии. Эти организмы представляют собой клетки или нитевидные структуры. Размножаются они почкованием. Почки образуются в строго определенных для каждого рода местах: либо непосредственно на клетках, либо на конце нити. У большинства видов почки подвижны. Организмы обычно одиночные, почкующиеся бактерии иногда существуют в виде агрегатов — микроколонии довольно сложной формы.

Миксобактерии. Из почвенных микроорганизмов большой интерес представляют миксобактерии. Среди них обнаруживаются представители как с кокковидными, так и с палочковидными клетками. Оболочка у миксобактерий эластична, поэтому клетки при движении изгибаются, и форма у них может меняться. Миксобактерии не имеют жгутиков. Они передвигаются, используя реактивный принцип. Выбрасывая комочки слизи, миксобактерии способны покрывать большие расстояния.

Миксобактерии размножаются делением и перешнуровыванием. У них относительно сложный цикл развития. В известный период жизни они образуют особые плодовые тела, по характеру строения которых проводится их классификация. Миксобактерии — сапрофиты. Распространены в почве, навозе, разлагающихся растительных остатках и т. д. Многие из них разлагают целлюлозу, хитин и другие вещества растительного и животного происхождения.

Актиномицеты. Актиномицеты, подобно грибам (описанным ниже), образуют обширный разветвленный мицелий, однако, как и бактерии, представляют собой одноклеточные организмы. Многие из них размножатся спорами, очень похожими на бактериальные клетки. Эти микроорганизмы могут быть аэробами (живущими при доступе воздуха) или анаэробами (живущими без доступа воздуха), патогенными (болезнетворными) или сапрофитами (питающимися мертвым органическим веществом), устойчивыми или неустойчивыми к кислотам. Очень многие из них образуют один или несколько пигментов (красящих веществ). Наконец,они отличаются высокой пластичностью (приспособляемостью).

Для почвенной микробиологии представляют интерес роды актиномицетов (актиномицес) и родственных им микромоноспор (микромоноспора), микобактерий (микобактериум) и проактиномицетов (проактиномицес). Среди других почвенных микробов, не относящихся к истинным бактериям, актиномицеты наиболее широко распространены в почвах. Они обнаруживаются в почвах всех типов, в том числе в некоторых кислых торфяниках, целинных и окультуренных, плодородных и неплодородных. Актиномицетов особенно много в почках, в которых происходит активное превращение органических веществ.

В песчаных почвах актиномицеты встречаются в небольшом количестве. Численность их несколько увеличивается весной и осенью, в тот период, когда почва обогащается органическим веществом. С глубиной число актиномицетов в почве уменьшается. Нейтрализация кислой почвы, внесение удобрений, особенно органических, чрезвычайно сильно стимулируют развитие актиномицетов. Выявлено, что нет веществ, содержащих углерод, стойких и наименее усваиваемых, которые не использовались бы актиномицетами. Актиномицеты могут использовать также разнообразные источники азота.