Рябина довольно устойчива к вредителям и болезням. Значительные повреждения отмечаются лишь в отдельные годы. Среди болезней, поражающих рябину, 5 видов пятнистостей листьев, 18 заболеваний ветвей и побегов, а также увядание листьев, парша плодов и листьев, мучнистая роса, склеротиния побегов, листьев, ягод и т. д. На рябине встречается около 30 видов вредителей: на листьях — пилильщики, паутинная моль совок, пяденицы, гусеницы, белянки, клещи; на цветках — галлицы, цветоеды; на плодах — яблоневый семяед, рябиновые большой и малый семяеды, яблоневый плодовый пилильщик, рябиновая моль; на стволах и ветвях щитовки и короеды.

Сильно снижают урожай рябины птицы. По мере развития промышленного выращивания рябины в отдельные годы можно ожидать массового распространения малоизвестных вредителей и болезней, как это произошло с черноплодной рябиной и другими новыми ценными плодово-ягодными растениями, внедренными в производство.

Рябиновая моль (Argyresthia conjugella Zell.). Распространена особенно сильно. В отдельные годы повреждает более 20% плодов. Встречается также на яблоне. Куколки зимуют в опавших листьях, в верхнем слое почвы и под отставшей корой, поэтому необходимо уничтожать растительные остатки. Бабочка с серовато-коричневыми передними крыльями появляется в конце мая — начале июня. Через 7—8 дней после вылета начинает откладывать яйца по одному или несколько штук на верхнюю часть завязи.

Яйцекладка продолжается до середины августа. Одна самка откладывает до 50 яиц. Гусеницы бледно-красной или серой окраски. Они выходят из яиц на 8—12-й день и проникают в мякоть плодов. Прокладывая узкий извилистый ход, гусеницы нередко добираются до семян и частично их выгрызают. Питаются около месяца — с середины июля до конца августа, затем через второе выходное отверстие покидают плоды и окукливаются.